HEX (Hexachlorfluorescein)

HEX wird als Reporterfarbstoff für TaqMan Sonden und für die Sequenzierung (ABI) verwendet. HEX ist schon während der Herstellung relativ unstabil und HEX-markierte Primer sind sehr hydrophob, was sich in veränderten PCR Effizienzen äußert, so daß HEX vermehrt durch andere Farbstoffe substitutiert wird. Applied Biosystems verwendet VIC, wir empfehlen Yakima Yellow (YAK), JOE, R6G oder Cy3 zu verwenden.

Abs

535 nm

 

Eps

 

Em

 

 

Q

 

HEX kann mit TAMRA, Dabcyl, BHQ-1, BHQ-2 und BBQ (BlackBerry) Quenchern kombiniert werden. Wir empfehlen die Verwendung von BBQ.

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